对于新鲜肛裂，非手术治疗即可愈合，如局部热水坐浴，便后用药物坐浴，可促使肛门括约肌松弛；溃疡面涂抹消炎止痛软膏，可促使溃疡愈合；口服缓泻剂，可使大便松软、润滑；疼痛剧烈者可保留灌肠，使括约肌松弛。

对于陈旧性肛裂，则需要使用手术切除、包括溃疡连同皮赘（前哨痔）一并切除，还可切断部分外括约肌纤维，减少术后括约肌痉挛，有利愈合。

手术方法大致有以下几种方法：

1.切除术：适用于Ⅲ期或慢性肛裂，术后效果好，少反复。

2.后方内括约肌切开术：主要目的是消除内括约肌痉挛。

3.侧方内括约肌切开术：主要目的是减少和防止肛门功能不良。

4.肛管扩张术：主要用于各种原因引起的肛管弹性消失和收缩，括约肌功能不良，发生的器质性狭窄。

5.V-Y肛管成形术：适用于肛管皮肤缺损及明显狭窄的肛裂。

6.肛门周围皮肤裂治疗：应依据病因病情来选择手术与否。

7.肛裂并有Ⅰ期或小型Ⅰ期内痔：应先做侧方内括约肌切开术，肛裂治好后再注射治疗内痔。

8.其他方法：如肛泰吻合器切除术或者高频电镊治疗方法等先进方法治疗，比传统手术更安全、疼痛小、创口小、愈合快。